一位干尽坏事的邪恶科学家（阿久野次郎）和姐姐（阿久野荣子），因为所属的邪恶组织被正义的一方所歼灭的关系，逼使他们必须开始过普通人的生活。好心的叔叔可怜他们，于是就提供家中的空房间让他们借住。次郎也因此与素未谋面的表妹（渡恭子）有了第一次的接触。一位讲话不经大脑又总是爱把「改造」两字挂在嘴边的坏蛋科学家与一位身材娇小、个性火爆但却又深受男生欢迎的小女生，到底会擦出什么样的火花呢？（2010年4月7日上市）
落魄武士的真面目，终于在本集中揭晓了！武士的来头不小，他闯进恭子家的目的，竟然是要迎娶恭子为妻！？恭子的命运到底会如何呢？次郎又将如何阻止自己的改造体被别人夺走呢？另外恭子后援会的成员们，为了在恭子的生日当天能够给她的惊喜，于是便邀请了小雪、小秋和次郎一起加入生日派对的准备工作。但是生日这一天对于恭子来说，其实也是个不幸的一天。这场暗地里进行的惊奇生日派对是否能够成功呢？（2010年4月7日上市）
次郎的大姊・阿久野绫为了确认次郎有无遭受恭子的虐待，而忽然探访恭子家。恭子是否会遭受邪恶组织的迫害呢？为了抢夺社办，学校里头最受欢迎的山下实后援会，将正面挑战渡恭子后援会！渡恭子后援会是否能够打赢这场仗呢？另外，学生们人人引颈期盼的暑假即将到来，但次郎却因为不想放暑假而挟持了校长！学生究竟是否能够顺利放暑假呢！？（2010年7月19日上市）
恭子和次郎的两人终于搭上新干线，前往次郎的故乡。一路上灾难不断的两人，是否会因此而擦出爱情的火花呢？在抵达次郎的老家之后，次郎的家人们又将如何对待恭子呢？另外，令人匪夷所思的吸血鬼首领・枕崎琉那与家佣机器人・恭子二号也将在本集登场！这两人是否成为恭子的情敌呢？她们将会为恭子带来什么样的威胁呢？（2010年8月20日上市）
恭子一家人前往温泉旅馆度假，不料竟认识了另一个邪恶组织的科学家‧仓田真一。仓田为了让恋人死而复活，抓了一堆女观光客活体回来做实验，恭子也是被掳女生其中之一。因为这个意外事件，次郎好像开始意识到自己对恭子的心意？！（2010年12月30日上市）
次郎和恭子这对欢喜冤家，每次次郎发明的道具闯祸，都反而促进了他们俩人之间的暧昧情愫。因为次郎发明的记忆丸道具，恭子意外发现原来自己小时候曾说过要当次郎新娘，但因为次郎这个二愣子不解风情，所以使得两人之间迟迟无法拉近距离？（2011年3月15日上市）
本来乐在学校生活中的次郎，在升上高二开学典礼的时候，突然冒出了个外国弟弟来？次郎一时之间不知该如何与这个外国弟弟相处，但经过恭子劝说后，兄弟俩大打一架之后，反而拉近了彼此的距离？！另外又蹦出了绿谷妹来，还阴错阳差地爱上了次郎？情节越来越精彩。（2011年11月7日上市）
考完试后即将要进入暑假前，有人提议要去次郎九州老家玩，但众人苦无旅费。刚好小秋的父亲苦无人手去海边设摊卖东西，恭子一行人决定前去打工赚旅费。就在大伙儿筹到资金前往九州途中，次郎和恭子却因一个意外，两人之间急速拉近了关系？（2011年12月20日上市）
可以充分享受青春岁月、享受日常生活型的爱情喜剧「天才恶少年」！高2下学期终于要开课了！对次郎来说，即将要迎接第2次的校庆到来！这时次郎竟然跟恭子一起担任执行委员的工作。就在这时候也出现了新的邂逅？进路谘商，荣子姐秘密的一天等等，本集故事当中也充满了很多活动！（2012年4月26日上市）
度过圣诞节和新年之后…开始放寒假的次郎一行人有很多的活动！可是就在这个时候，黑泽竟然被神秘的男女二人组给袭击。破坏次郎「日常生活」的〝敌人〞真正身份是…！？「天才恶少」遇到了史上最大的危机，次郎和荣子姊也进入了认真模式！？比平常的内容还要多，收录有11篇故事，剧情紧张的新篇！（2012年9月4日上市）
在情人节当天爱情让人心头小鹿乱撞。像这种平日型的喜剧「天才恶少年」也终于要第一次进入大混战篇了！敌对组织想要排除掉正义和邪恶的一方，和「真世界」的全面开战只剩下一个月的时间！利用秘密的修行场地＆新的道具，次郎一行人开始展开猛烈特训，到决战日当天，他们是否能变强呢？惊涛骇浪的情节展开令人感到担心紧张（？），共收录有10篇故事！（2012年12月27日上市）
力量变强的次郎，终于赶上了跟「真世界」的对战！次郎VS来栖，这两个首领终于要面对面迎战了，战斗即将要进入高潮！那个变得很可爱的女生也要再次出场了，令人紧张的爱情对战也即将要爆发了？还有，明明是属于邪恶组织的人，竟然参加了英雄考试赛…
内容相当精采丰富，共收录有10篇故事！
（2013年3月7日上市）
次郎所创立的邪恶组织分部！
好像少了一点东西…正这么想的时候，
原来是少了顾问老师？
暑假到了，好玩的活动
就像狂风巨涛般涌来！
合宿、探病、联考、穿泳装去游泳池、
神秘的离奇事件etc.
还有这个啊！像这样等等，
为你送上天才恶少年世界全开的10篇故事！
（2013年4月18日上市）
夏天快结束时发生了大事件！
次郎是否能够平安地救回被人绑架的恭子…？
还有、还有！其他的角色也很活跃！
黑泽＆大神这对组合也有所进展？
小雪×绿谷、小秋×赤城的爱情发展到底会如何？
插科打诨、爱情喜剧、打斗etc.
精采内容故事共有11篇！（2013年5月30日上市）
现在进入了高中三年级下学期了！
为了烦恼将来进路的恭子，次郎的发明小道具，以及各式各样的成员们引起了一些事件！性格转向、银行强盗、忍者VS吸血鬼etc﹒最后竟然连模拟告白都来了…！！那些女性角色们引起了不得了的事！？还有「天才恶少」史上最大的危机将要到来，次郎他们的友情会…精采故事让你目不暇给，共收录有10篇故事！（2013年7月9日上市）
（完结篇）过完年了，大学联考也将近了，快乐的高中生活只剩下没几天了！在毕业前的活动当中，他们两个急速拉近＆破天荒算是变成一对情侣！？还有，次郎的父亲终于登场了！「邪恶首领」跟「友情」被放在天平两侧，大家会变得四分五裂吗？有笑有泪，也有暧昧♥完结篇之后的附赠漫画当中，收录有很多的插曲故事！从「恶」开始的青春爱情喜剧故事，『天才恶少年』本集将迎向完结篇！（2013年11月19日上市）
