长谷川光司

平凡的小学三年级的小学生高町奈叶和一个来自为太古遗产进行挖掘而来异世界米德芝尔达的尤诺·斯克莱亚的魔法邂逅下，成为了与尤诺一起对平行次元中存在的高度科技的文明的遗产——“圣石之种”进行收集的魔法少女。

时间回溯到四年前。昴·中岛在遭到机场火灾卷入而几乎丧命之际，由于奈叶的出现而得救。因为憧憬着如同“自己理想中的形象”一般的奈叶，昴在当晚的满天星空之下，做出了“成为管理局的魔导师”的决定。四年后，经过一番波折而顺利成为管理局的新进魔导师的昴，与训练校时代的伙伴蒂雅娜·兰斯特共同挑战魔导师的升格试验。

围绕着「闇之书」的少女们，她们之间的奋战与友情的故事…本书为动画版「魔法少女奈叶」的官方补完版漫画，并由原着轻小说作者亲自操刀，将动画版中未及详述的环节，以漫画方式补完。