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这世界上分布着各种不同的岛，这就是我们所说的「HOME」。每个「HOME」都有各自独立的文化和历史，另外也有「人」以外的种族握有主权的「HOME」。单是目前所知道的，全世界已经有百个以上的「HOME」！负责发现、调查和探索这些「HOME」的专家，就是「航务员」！从小生活在未开发「HOME」的美绪，为了要找到让自己兴奋的事物，决定加入航务员的行列，但是……
这次校外教学的任务是前往之前发现的「完全未开发ＨＯＭＥ」进行调查与探索，为了加深美绪跟莉卡之间的感情，莎拉小姐提议让她们两位以助手的身分随行。到了岛上之後，因为艾吉使出浓雾的关系，岛上开始产生地震，结果还害得莉卡落水。
刚从外海回来的迦里欧雷向理事长建议进一步拓展外海，於是便请迦里欧雷的弟子多尔切去找莉卡来。随後并且正式宣布莉卡成为外海调查团的成员之一，美绪在门外听见此消息，也自告奋勇想要参加，不过却以时候未到的理由遭到拒绝。
美绪一行人经过几天的航行之後，终於来到了会合地点威仙夏弗特，不过要进入该ＨＯＭＥ必须提出申请，可是他们并未事先提出，加上葛立夫的航务员手册备之前的海盗团给偷走了，情急之下葛立夫出手打昏了审查官，一行人只好硬闯。
我们将要看到的是个未知的世界。不见得每件事都是好事──。『星星落下的岛』、『生命之火』…。航务员一行人抵达的岛屿充满了新鲜的惊奇。受到外海幻想般的景象吸引，美绪他们相当雀跃。不过他们还不知道有严苛的命运正在等着…。
为了想要长生不老，盯上美绪的神秘团体发动攻击，使得航务员们接连受伤。此时美绪一行人来到全新的ＨＯＭＥ，再次确认对未知的探究心理…。如今，离别的时候来到──
尼尔瓦纳把美绪一行人困在船上，接着就带着他的手下跟着杨准备前往航务员本部。而在航务员本部的理事长也得知尼尔等人即将来找碴的消息，原本她要大家赶快撤退，但是包括萨格拉在内没有人愿意离开，於是他们决定携手对付敌人。
（完结篇）卡居带着美绪是图逃离，不过却还是被阿尔基米斯特追上，他不但派出自己所打造的最佳杰作艺术品「克雷亚多」来攻击，被打败之後竟然说出美绪的真正身分其实是由雷基的ＪＩＮＸ能里所打造出来的人偶，这让美绪一时无法接受。她能够重新振作起来吗？
