在使用中子弹的恐怖攻击行动「血色星期一」解决之后两年，绰号「猎鹰」的黑客高木藤丸不再接触电脑，并在一家咖啡厅打工。这时候发生一起劫机事件，犯人要求政府释放恐怖组织「魔弹射手」的首领。没想到劫机犯的其中一人，居然是藤丸的父亲龙之介！

在「魔弹射手」发动的恐怖攻击被藤丸与「THIRD-i」成功联手阻止的1年后，世界上12个国家的元首为了召开高峰会而聚集到东京。「THIRD-i」依照惯例负责保护会场的安全。但是却有两股势力蠢蠢欲动……

有着当员警的父亲、有个两肋插刀的朋友还有个可爱妹妹的天才高中生黑客高木藤丸，因为他父亲的关系被卷人一起恐怖事件中后，生命受到威胁，身边出现内奸，还要追查幕后主使者是谁…

国际通缉的恐怖份子许克尔搭乘的飞机在成田机场降落。警方为了掌握恐怖计画的整个内容而准许他入境日本。此时，勇午接受了俄罗斯总统前任首席顾问夫人的委托。请他去交涉以防止他遭人杀害──距离洞爷湖高峰会开幕还剩下２星期！