「人类」遭到非比寻常的「兽」蹂躏而灭亡了。除了独自从数百年沉眠中苏醒的青年威廉以外。唯有「圣剑」与使用圣剑的妖精兵能代替「人类」打倒「兽」。战斗过后，「圣剑」能再次被他人使用，但用尽力量的妖精兵们却会殒命。「至少，我也希望自己不用消失，也想让别人记住。

故事发生在一个纷争不绝的异世界，它被称为杰米娜。而15岁的少年柾木剑士被召唤到了那个异世界。被卷入到纷争中去的他操纵着杰米娜的战斗兵器—古代遗迹发现巨人体所复制而成的圣机人进行战斗。而由于操纵圣机人的圣机师的耐性问题，所以机师异界人居多。最终剑士会有什幺样的际遇呢？